技术文章
以下是经过优化的 siRNA转染标准操作流程,整合了关键参数优化与避坑指南,适用于绝大多数哺乳动物细胞系(贴壁/悬浮),分为 实验设计、操作步骤、质控要点三部分:
一、实验设计关键点(转染前必看)
要素 | 推荐方案 | 避坑提示 |
siRNA浓度 | 终浓度10-50nM(预实验梯度测试) | >100nM易致脱靶效应 |
细胞密度 | 贴壁细胞:30-50%汇合度 | 过密→毒性↑;过低→效率↓ |
转染试剂 | Lipofectamine™ RNAiMAX(通用) | 避免含血清培养基稀释试剂 |
对照设置 | - 阴性对照:Scrambled siRNA | 缺一不可! |
二、标准操作流程(以24孔板为例)
Day 0:细胞铺板
1. 消化细胞 → 用wanquan培养基 调整密度 → 每孔接种 0.5mL(贴壁细胞数:5-8×10⁴;悬浮细胞数:2×10⁵)
2. 37℃培养箱放置 16-24h(目标:转染时汇合度≈40%)
关键细节:
- siRNA工作液浓度 = 储存浓度×30(例:20μM储存液→工作液终浓度≈33nM)
- 转染试剂用量参考说明书(RNAiMAX通常 试剂:siRNA体积比=1:1)
Day 2:换液与检测
1. 转染后 6h 更换wanquan培养基(高毒性细胞如原代神经元需4h内换液)
2. 继续培养 24-72h(基因沉默峰值时间需预实验确定)
三、质控关键步骤(决定成败!)
1. 转染效率验证(必做)
- 方案1:转染 FAM标记siRNA → 24h后荧光显微镜观察(效率>80%合格)
- 方案2:共转染 EGFP质粒 → 计算绿色细胞占比(成本低但间接)
2. 沉默效果检测
3. 细胞毒性评估
- MTT法:转染后24h检测,存活率应>85%
- 形态观察:悬浮细胞聚团、贴壁细胞空泡化→提示毒性过强
四、高频问题解决方案
问题 | 原因 | 优化方案 |
效率低 | siRNA降解/试剂失效 | 新解冻siRNA;更换转染试剂批次 |
细胞死亡率高 | 复合物局部浓度过高 | 转染前混匀培养基;悬浮细胞用旋转培养法 |
沉默效果不稳定 | 基因半衰期长 | 延长检测至72h;转染两次(间隔24h) |
脱靶效应 | siRNA种子区匹配非靶基因 | 更换siRNA序列;使用化学修饰siRNA(如Stealth™) |
五、特殊细胞优化方案
1. 原代细胞:
- 转染试剂:选 DharmaFECT™ Primary 或 jetPRIME®
- 方案:转染前饥饿处理2h(无血清培养基)→ 复合物孵育时间缩短至5min
2. 悬浮细胞:
- 试剂:Neofect™ DNA/RNA Transfection Reagent
- 步骤:离心收集细胞 → 重悬于复合物 → 24孔板每孔接种500μL(密度5×10⁵/mL)
3. 难转细胞(如神经元):
- 专用试剂:NeuroFect™(佐剂提高穿透性)
- 转染后不换液 → 直接补等体积wanquan培养基
六、试剂耗材推荐表
类型 | 推荐产品 | 适用场景 |
通用转染试剂 | Lipofectamine™ RNAiMAX | 293T/HeLa等常见细胞 |
难转细胞试剂 | jetPRIME® | 原代/干细胞/悬浮细胞 |
阳性对照siRNA | Silencer™ GAPDH siRNA | 体系验证 |
阴性对照 | AllStars Neg. siRNA | 排除非特异效应 |
> 数据标准:合格实验需满足——转染效率>80% + 沉默效率>70% + 细胞存活>85%
避雷总结:
1. 勿用含抗生素或血清的培养基稀释复合物(灭活试剂)
2. 转染后换液时间宁早勿晚(超8h毒性飙升)
3. 冻存siRNA避免反复冻融>3次(分装储存-80℃)
按照此流程操作,可稳定获得可重复的基因沉默数据!
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